Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eif3aP23116 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eif3aP23116 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms