Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk1P22518 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk1P22518 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk1P22518 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Clk1P22518 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk1P22518 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms