Protein–RNA interactions for Protein: P21440

Abcb4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb4P21440 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcb4P21440 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms