Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PrkcaP20444 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms