Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a1P19437 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms