Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NefhP19246 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NefhP19246 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NefhP19246 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NefhP19246 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NefhP19246 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NefhP19246 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NefhP19246 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NefhP19246 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NefhP19246 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NefhP19246 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NefhP19246 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NefhP19246 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NefhP19246 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NefhP19246 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NefhP19246 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NefhP19246 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NefhP19246 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NefhP19246 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NefhP19246 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NefhP19246 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NefhP19246 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NefhP19246 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NefhP19246 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NefhP19246 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NefhP19246 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NefhP19246 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NefhP19246 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NefhP19246 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NefhP19246 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NefhP19246 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NefhP19246 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NefhP19246 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NefhP19246 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NefhP19246 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NefhP19246 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NefhP19246 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NefhP19246 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NefhP19246 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NefhP19246 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NefhP19246 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NefhP19246 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NefhP19246 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NefhP19246 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms