Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Csn1s1P19228 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms