Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc1P19123 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms