Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sdc1P18828 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206 ms