Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms