Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp53P15975 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms