Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd5P13379 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd5P13379 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd5P13379 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd5P13379 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd5P13379 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd5P13379 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd5P13379 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd5P13379 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd5P13379 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd5P13379 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd5P13379 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd5P13379 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd5P13379 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cd5P13379 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cd5P13379 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms