Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb1P13372 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms