Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sub1P11031 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sub1P11031 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Sub1P11031 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sub1P11031 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sub1P11031 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sub1P11031 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sub1P11031 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sub1P11031 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sub1P11031 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Sub1P11031 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms