Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calm3P0DP28 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms