Protein–RNA interactions for Protein: P0DP27

Calm2, Calmodulin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm2P0DP27 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm2P0DP27 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm2P0DP27 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm2P0DP27 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm2P0DP27 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm2P0DP27 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm2P0DP27 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm2P0DP27 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm2P0DP27 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm2P0DP27 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calm2P0DP27 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calm2P0DP27 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calm2P0DP27 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Calm2P0DP27 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms