Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Becn2P0DM65 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms