Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a2P08122 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms