Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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TtrP07309 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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TtrP07309 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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TtrP07309 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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TtrP07309 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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TtrP07309 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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TtrP07309 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TtrP07309 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TtrP07309 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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TtrP07309 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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TtrP07309 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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TtrP07309 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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TtrP07309 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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TtrP07309 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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TtrP07309 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TtrP07309 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TtrP07309 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TtrP07309 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TtrP07309 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TtrP07309 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TtrP07309 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TtrP07309 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TtrP07309 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TtrP07309 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TtrP07309 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TtrP07309 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TtrP07309 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TtrP07309 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TtrP07309 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TtrP07309 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TtrP07309 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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