Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgfb1P04202 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tgfb1P04202 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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