Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mtnd1P03888 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mtnd1P03888 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms