Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01649 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01649 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01649 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01649 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms