Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BlmO88700 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BlmO88700 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BlmO88700 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BlmO88700 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BlmO88700 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BlmO88700 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BlmO88700 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BlmO88700 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BlmO88700 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BlmO88700 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BlmO88700 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BlmO88700 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BlmO88700 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BlmO88700 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BlmO88700 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BlmO88700 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BlmO88700 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
BlmO88700 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BlmO88700 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BlmO88700 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BlmO88700 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BlmO88700 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BlmO88700 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BlmO88700 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BlmO88700 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BlmO88700 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BlmO88700 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BlmO88700 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BlmO88700 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BlmO88700 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BlmO88700 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BlmO88700 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BlmO88700 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BlmO88700 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BlmO88700 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BlmO88700 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BlmO88700 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BlmO88700 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BlmO88700 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BlmO88700 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BlmO88700 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BlmO88700 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BlmO88700 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BlmO88700 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BlmO88700 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BlmO88700 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BlmO88700 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BlmO88700 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BlmO88700 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BlmO88700 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BlmO88700 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BlmO88700 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BlmO88700 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BlmO88700 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BlmO88700 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BlmO88700 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BlmO88700 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BlmO88700 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BlmO88700 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BlmO88700 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BlmO88700 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BlmO88700 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BlmO88700 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BlmO88700 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BlmO88700 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BlmO88700 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BlmO88700 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BlmO88700 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BlmO88700 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BlmO88700 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BlmO88700 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BlmO88700 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BlmO88700 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BlmO88700 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BlmO88700 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BlmO88700 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BlmO88700 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BlmO88700 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BlmO88700 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BlmO88700 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BlmO88700 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BlmO88700 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BlmO88700 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BlmO88700 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BlmO88700 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
BlmO88700 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BlmO88700 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BlmO88700 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BlmO88700 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms