Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnk2O54967 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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