Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn5O54942 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn5O54942 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn5O54942 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn5O54942 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn5O54942 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn5O54942 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn5O54942 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn5O54942 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn5O54942 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn5O54942 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn5O54942 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn5O54942 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn5O54942 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn5O54942 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn5O54942 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn5O54942 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn5O54942 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn5O54942 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn5O54942 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn5O54942 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms