Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
CrxO54751 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
CrxO54751 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CrxO54751 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CrxO54751 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CrxO54751 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CrxO54751 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CrxO54751 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CrxO54751 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
CrxO54751 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CrxO54751 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CrxO54751 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
CrxO54751 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CrxO54751 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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