Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Timm44O35857 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timm44O35857 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timm44O35857 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timm44O35857 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Timm44O35857 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms