Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cited2O35740 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms