Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh2d1bO35324 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sh2d1bO35324 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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