Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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H2-Q1O19441 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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H2-Q1O19441 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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H2-Q1O19441 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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H2-Q1O19441 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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H2-Q1O19441 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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H2-Q1O19441 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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H2-Q1O19441 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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H2-Q1O19441 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
H2-Q1O19441 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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