Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LhbO09108 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LhbO09108 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LhbO09108 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LhbO09108 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LhbO09108 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LhbO09108 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LhbO09108 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LhbO09108 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LhbO09108 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LhbO09108 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LhbO09108 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LhbO09108 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LhbO09108 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LhbO09108 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
LhbO09108 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LhbO09108 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
LhbO09108 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
LhbO09108 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms