Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm3239L7N2D9 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm3239L7N2D9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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