Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm2056J3QQ02 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms