Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm20795J3QP49 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms