Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Cldn34c3J3QJW5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Cldn34c3J3QJW5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Cldn34c3J3QJW5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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