Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gm21818J3KMS6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gm21818J3KMS6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gm21818J3KMS6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gm21818J3KMS6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gm21818J3KMS6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gm21818J3KMS6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gm21818J3KMS6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm21818J3KMS6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gm21818J3KMS6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Gm21818J3KMS6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Gm21818J3KMS6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Gm21818J3KMS6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm21818J3KMS6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm21818J3KMS6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm21818J3KMS6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm21818J3KMS6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21818J3KMS6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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