Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm17535J3KMR8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm17535J3KMR8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm17535J3KMR8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm17535J3KMR8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17535J3KMR8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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