Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Vmn1r34G3XA52 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Vmn1r34G3XA52 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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