Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9yF8VPU6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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