Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm8005F6YKY3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8005F6YKY3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms