Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm8247F6VRJ8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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