Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sptbn5F6UCX4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sptbn5F6UCX4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sptbn5F6UCX4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn5F6UCX4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn5F6UCX4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn5F6UCX4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn5F6UCX4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn5F6UCX4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn5F6UCX4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn5F6UCX4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn5F6UCX4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn5F6UCX4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn5F6UCX4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn5F6UCX4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn5F6UCX4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn5F6UCX4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn5F6UCX4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sptbn5F6UCX4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms