Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lmod3E9QA62 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmod3E9QA62 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms