Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Pdzd2E9Q1M1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pdzd2E9Q1M1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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