Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm20425E9Q035 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms