Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ttc17E9PVB5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ttc17E9PVB5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ttc17E9PVB5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ttc17E9PVB5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ttc17E9PVB5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ttc17E9PVB5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ttc17E9PVB5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ttc17E9PVB5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc17E9PVB5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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