Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gcn1E9PVA8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gcn1E9PVA8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms