Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Syde2E9PUP1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms