Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5934D3Z4U6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms