Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms